Портал коллекций грибов Западной Сибири

Сибирский микопортал – это портал – агрегатор микологических коллекций на территории Сибири (в узком смысле – Западной Сибири, но возможно расширение границ проекта в будущем). Публикация баз данных коллекций в сети с организованным поиском и возможностью скачивания данных обеспечивает надежное использование их в систематике, географии грибов и других областях микологии. Оцифровка коллекций дает возможность провести ревизию и учет и обеспечивает надежность хранения информации.

Как принять участие:

  • Заполнить данные о Вашей коллекции
  • Начать оцифровку коллекции
  • Организовать работу с данными коллекции на портале Specify
  • Принять участие в написании коллективной статьи о данных Сибирских коллекций грибов

Целью проекта «СибМикоПортал» является создание единого ресурса доступа к коллекциям грибов и грибоподобных организмов, расположенных на территории Сибири, в том числе:

  1. Создание перечня коллекций грибов с аннотациями о хранящихся образцах, публикация перечня на СибМикоПортале и в виде наборов данных формата (Metadata only) на портале GBIF (результат к концу 2024 года)
  2. Создание аккаунтов коллекций на СибМикоПортале (в ИС Specify 7) и аккаунтов пользователей (результат к концу 2024 года)
  3. Оцифровка данных коллекций одним из способов (результат к концу 2025 года)
    1. Ввод информации об образцах в шаблон Excel и пакетный импорт в ИС Specify
    1. Ввод информации об образцах непосредственно в ИС Specify
    1. Импорт базы данных коллекции на СибМикоПортал, если она уже существует в виде таблицы или базы данных на ресурсах организации
  4. Экспорт данных коллекций в соответствующие наборы данных в GBIF (результат к концу 2025 года)
  5. Публикация «статьи о данных» (data paper) с описанием оцифрованных сибирских коллекций грибов и историей развития коллекций на территории Сибири (результат к концу 2025 года)

Принять участие в проекте смогут все микологи, имеющие коллекции грибов, собранные на этой территории. Команда проекта будет включает координатора, 2-3 специалиста, ответственных за IT протоколы работы, и пользователей – микологов. В оцифровке коллекций может принимать участие от одного до нескольких человек, в зависимости от масштаба коллекции.

Календарный план проекта рассчитан на 2024-2025 годы (с сохранением данных на портале на неопределенное время в будущем).

Проект начинается на волонтерской основе, в будущем возможно получение финансирования на отдельные задачи или поддержку проекта в целом.


Справочные материалы

Регистрация коллекций грибов на СибМикоПортале (анкета для сбора информации о коллекциях)

Пример набора данных коллекции грибов YSU на портале GBIF

Сибирский мико портал (http://mycoportal.ugrasu.ru/)

Шаблон для оцифровки коллекции грибов в таблице Excel (скачать файл xls)

Вход в демо-аккаунт ИС Specify (логин пароль)


Инструкции

Приглашение к сотрудничеству и знакомство с инструментами

Видео-инструкция по геопривязке образцов (заполнению координат) по географическому описанию с использованием яндекс-карт (https://youtu.be/vNQ7MjS_vQs)

Видео-инструкция по экспорту данных коллекций из базы на портал СибМикО (https://youtu.be/AJ_pHZRZ41A)

Видео-инструкция по работе с набором данных коллекции, размещенном на портале GBIF (https://youtu.be/-70FvJM8VV0)

Знакомство с ИС Специфай на примере аккаунта Фунгария NSK (https://youtu.be/p-ivhaVUNuA)


Контакты:

Филиппова Нина Владимировна, координатор проекта:

  • Информационная рассылка о проекте
  • Создание структуры коллекций в БД Specify для пользователей СибМикоПортала
  • Подготовка шаблонов и инструкций по оцифровке данных
  • Интеграция оцифрованных данных
  • Экспорт данных на платформу GBIF

Карпов Дмитрий Викторович, IT специалист, администратор установок Specify и IPT на сервере ЮГУ